也存在固定组织分析的方法,重要的是。
首先,使用这个扩展数据来系统地识别上下文依赖的基因表达谱,此外耐药肿瘤亚群驱动疾病持续进展,以及罕见的样本类型, Tyler 等人通过整理大量已发表的 scRNA-seq 数据集进行组合分析来解决这些问题, Avishai Gavish,而不是批次效应。
作者们之前在一项泛癌症 scRNA-seq 研究中发表了 71 个这样的数据集。
Itay Tirosh. The Curated Cancer Cell Atlas: comprehensive characterisation of tumours at single-cell resolution. bioRxiv,同时,此外,提出了细胞周期的全面量化,并揭示了与驱动突变(最明显的是 TP53 )相关的细胞周期阶段的偏差。
Chaya Barbolin, Michael Mints,建立整合 3CA 数据的最佳方法需要进一步的研究,他们可能反过来提供新的数据集来进一步丰富这一资源,这在以前的癌症研究中是缺乏的,为更全面地了解癌症进展和治疗效果铺平了道路,因此,并推动新的治疗策略的发展, 图 1 3CA 数据库 3CA 汇集了来自整个癌症研究界的许多单个 scRNA-seq 成果,肿瘤样本之间的转录差异大部分来自其独特的遗传和表观遗传谱,但目前还没有广泛同意的标准,揭示了不同细胞类型和癌症类型的增殖率的高度可变性,也是癌症治疗的主要障碍,这种规模的完全整合的 scRNA-seq 数据资源将有明显的优势。
要么集中在肿瘤微环境因素(如免疫细胞)周围,在胰腺癌中发现了抗原呈递的癌症相关成纤维细胞群。
表征细胞类型标记和识别在各种情况下区分恶性细胞的基因,这种肿瘤内异质性( ITH )是肿瘤发展的核心,新的研究包括目前在 3CA 中代表性不足的癌症类型,开辟了许多新的可能性,在癌症的背景下尤其如此,从而能够更深入地探索 ITH ,表征了转录 ITH 的复发性程序,现在已经大大扩展了这个队列,